市政与环境工程学院是1956年学校建校时设立的系部，前身为原吉林建筑工程学校城市建设系，1979年学校升格为本科办学，开始招收供热通风专业本科生，1983年开始招收给水排水工程专业本科生，2002年开始招收环境工程专业本科生，2003年环境科学开始招收本科生。随着吉林建筑大学的发展，市政与环境工程学院办学规模逐步扩大，目前拥有松辽流域水环境教育部重点实验室、松辽流域水资源与水环境重大需求协同创新中心、水污染控制与资源化利用吉林省高校重点实验室、吉林省建筑节能与新能源利用工程研究中心、吉林省新能源与环境科技创新中心、吉林省校企联合供热低碳化研究中心、吉林省超导传热材料与中低温热能减碳技术跨区域合作科技创新中心、北方宜居农房工程技术创新中心8个省部级科研平台。学院设有给排水科学与工程、建筑环境与能源应用工程、环境科学与工程等3个系，环境科学与工程实验中心、建筑环境与能源应用工程实验中心等2个本科实验中心。开设建筑环境与能源应用工程、建筑环境与能源应用工程（分设城市燃气工程方向）、给排水科学与工程、环境工程、环境科学等4个本科专业，5个方向，其中建筑环境与能源应用工程专业于2019年获批首批国家级一流专业建设点、给排水科学与工程专业于2020年获批第二批国家一流专业建设点，环境工程专业于2020年获批吉林省一流专业建设点，环境科学专业于2021年获批吉林省一流专业建设点，环境工程专业于2018年通过教育部工程教育专业认证，给排水科学与工程专业、建筑环境与能源应用工程专业于2019年通过住建部高等教育专业评估（认证），给排水科学与工程专业于2023年入选吉林省卓越工程师教育培养计划2.0专业，获批校级海绵城市微专业。建筑环境与能源工程实验中心于2011年被评为省级实验教学示范中心，环境科学与工程实验中心于2014年被评为省级实验教学示范中心。

市政与环境工程学院现有环境科学与工程，市政工程，供热、供燃气、通风与空调工程，土木水利（市政工程），土木水利（暖通空调工程）、资源与环境（环境工程）6个硕士学位点和20多个研究方向。2003年，学院获得了市政工程方向的工学硕士、专业硕士学位授予权，及暖通空调工程方向的专业硕士学位授予权。2006年市政工程学科被评为吉林省重点学科。市政工程和供热、供燃气、通风及空调工程所属一级学科土木工程2011年被评为吉林省“十二五”优势特色重点学科，2014年被评为吉林省首批“重中之重”建设学科，2018年被评为吉林省高水平学科“一流学科A类”。环境科学与工程学科始建于2002年，2011年入选吉林省“十二五”优势特色重点学科、2018年入选“十三五”优势特色学科A类。2024年吉林省特色高水平学科首轮建设周期验收结果被评为“优秀”。2024年5月，科睿唯安（Clarivate Analytics）公布的ESI最新数据（数据覆盖2014至2024年）显示，学校环境/生态学学科首次进入ESI全球学科排名前1%。2024年建设“水环境与绿色能源”为吉林省特色高水平学科群。

学院现有全日制在校学生共计1513人，其中本科生1247人，硕士研究生266人。学院积极推进研究生教学改革，强化高层次人才培养质量。建设省级精品示范课程2门、省级教学案例3项；获评吉林省优秀硕士学位论文20篇，研究生获各类竞赛奖励64项。

学院拥有一支学术水平较高、梯队结构合理的教师队伍。现有“城市水环境与水质工程技术”创新团队、“低碳建筑绿色供能与环境调控集成技术”创新团队和“浅层地热能利用与环境评价”创新团队3个省级科研团队。学院教师95人，其中，具有正高级职称26人，副高级职称32人，具有高级职称教师占教师总数的61％，培育国家特聘教授1人。教师中具有博士学位的65人，占教师总数的68%。45岁以下的青年教师58人，占教师总数的61%。

学院围绕国家重大战略需求，结合地域特色开展一系列前沿科学研究，不断推出高水平科研成果，依托8个省部级科研平台，承担国家重点研发计划课题、国家自然科学基金重大研究计划项目、国家自然科学基金区域创新发展联合基金项目、国家重点研发计划子课题等国家级科研项目73项，省部级科研项目131项，横向课题63项，累计获得科研经费1.38亿元；产出一批具有自主知识产权的创新性成果，获得省部级以上科研奖励30项，发表高水平学术论文1400余篇，其中SCI收录311篇，授权发明专利144件，制定地方标准及行业规程9部。

经过长期的发展与建设，形成了稳定的学科方向，具有自己的特色和优势。新能源开发与有效利用技术、农村面源污染控制理论与技术、水体生态系统修复理论与技术、污水处理与资源化理论与技术等方面的研究在国内处于领先水平，实际应用方面也取得显著成果，取得了系列重要的标志性成果。研究成果具有鲜明的地域特色，注重转化和推广应用。学院近年来一直面向国家及省内重大需求，围绕学科关键问题开展科学研究与人才培养，已经成为省内市政与环境领域人才培养基地、科技研发基地、行业决策和技术咨询基地，为吉林省城乡建设行业及地方经济发展作出了突出贡献。